Στον κόσμο του Φθινόπωρο , οι χερσαίοι χώροι κατακλύζονται σχεδόν τελείως με μεταλλαγμένες βρωμιές που δεν θα σκεφτούν τίποτα να σας κάνουν το επόμενο γεύμα τους. Ένα από τα πιο διάσημα από αυτά τα πλάσματα είναι τα Super Mutants. Αυτά τα τεράστια πράσινα τέρατα ήταν κάποτε άνθρωποι. τώρα, έχουν μεταλλαχθεί σε βίαια πλάσματα που μοιάζουν με Χαλκ.
Σε αντίθεση με τα περισσότερα άλλα χερσαία πλάσματα, τα Super Mutants δεν ήταν αποτέλεσμα της πυρηνικής κατάρρευσης των βομβών. Κατά τη διάρκεια του πολέμου μεταξύ των Ηνωμένων Πολιτειών και της Κίνας πριν από την αποκάλυψη το 2077, πολλά υποκαταστήματα της κυβέρνησης και ορισμένων ιδιωτικών εταιρειών ανατέθηκαν να αναπτύξουν καινοτομίες για να κερδίσουν ένα πλεονέκτημα έναντι του εχθρού. Ένα έργο ήταν ο Forced Evolutionary Virus, ένας τεχνητά δημιουργημένος ιός από τη West Tek που αρχικά προοριζόταν να προστατεύσει από διάφορες μορφές βιολογικού πολέμου. Όταν το πραγματικό του δυναμικό έγινε εμφανές, το έργο μεταφέρθηκε στη Στρατιωτική Βάση Mariposa στο Midwest, ελπίζοντας να δημιουργήσει τους απόλυτους σούπερ στρατιώτες.
Οι άνθρωποι που το FEV δοκιμάστηκε παρουσίασε ανώτερη φυσική ικανότητα, αντοχή στην καταπολέμηση ζημιών, γήρανση, ασθένειες και υψηλά επίπεδα ακτινοβολίας. Ωστόσο, αυτοί οι μεταλλάκτες έγιναν πολύ λιγότερο έξυπνοι και εξαιρετικά βίαιοι σε οποιονδήποτε και οτιδήποτε δεν ήταν ένα από αυτά. Επιπλέον, οι μετασχηματισμοί τους είχαν ως αποτέλεσμα την απώλεια όλων των αναπαραγωγικών οργάνων τους, καθιστώντας τα χωρίς φύλο και στείρα. Αυτό σημαίνει ότι τα Super Mutants δεν μπορούν να αναπαραχθούν με φυσικό τρόπο και ο μόνος τρόπος για να κάνετε περισσότερα ήταν να μεταμορφώσετε περισσότερους ανθρώπους χρησιμοποιώντας τον ιό.
Προτού οι επιστήμονες της Mariposa μπορούσαν να ολοκληρώσουν την έρευνά τους, η τοπική φρουρά με επικεφαλής τον καπετάνιο Roger Maxon ανακάλυψε την αλήθεια για το έργο τους και έμαθε ότι υπέβαλαν αιχμαλώτους πολέμου στο FEV. Τρομοκρατημένοι, επαναστάτησαν και εκτελούσαν το ερευνητικό προσωπικό, σφραγίζοντας το FEV πριν τελικά φτάσουν στο Lost Hills Bunker για να σχηματίσουν το Αδελφότητα του χάλυβα . Μέχρι τα γεγονότα που οδήγησαν στη δημιουργία του πρώτου αληθινού στρατού του Super Mutant, η βάση θα ήταν εγκαταλελειμμένη για δεκαετίες.
Το 2102, μια αποστολή στη Mariposa ηγήθηκε από έναν έμπορο Hub που ονομάζεται Harold και έναν πρώην Vault Dweller με το όνομα Richard Gray. Όταν έσπασαν, δέχτηκαν επίθεση από την αυτοματοποιημένη ασφάλεια της βάσης, καθώς και από μερικούς που επέζησαν. Όλοι στην ομάδα σκοτώθηκαν εκτός από τον Χάρολντ, ο οποίος τραυματίστηκε αλλά κατάφερε να δραπετεύσει, και ο Γκρέι, ο οποίος κατά λάθος χτυπήθηκε σε ένα από τα δοχεία του FEV. Η παρατεταμένη έκθεσή του στον ιό τον οδήγησε να γίνει μια τρομερά μεταλλαγμένη μάζα σάρκας, αλλά με τεράστια αυξημένη νοημοσύνη, που αναγεννήθηκε ως The Master. Περαιτέρω μεταλλάξεις του έδωσαν την ικανότητα να συνδέει νευρο με υπολογιστές, επιτρέποντάς του να έχει πρόσβαση στις βάσεις δεδομένων της βάσης.
Μέσα από τον πειραματισμό, κατάφερε να δημιουργήσει νέους Super Mutants, μερικοί από τους οποίους διατηρούσαν ακόμα τη νοημοσύνη τους. Πιστεύοντας ότι αυτοί οι μεταλλάκτες ήταν οι μόνοι που μπορούσαν να επιβιώσουν ποτέ στη χερσαία χώρα, ξεκίνησε τις προσπάθειες να χτίσει έναν στρατό απαγάγοντας ανθρώπινους εποίκους και μεταμορφώνοντάς τους, χρησιμοποιώντας μια λατρεία της ημέρας των ανθρώπινων οπαδών ως μια πρώτη επιχείρηση. Ωστόσο, αυτές οι προσπάθειες καταστράφηκαν από την έγκαιρη παρέμβαση του Vault Dweller και της Αδελφότητας, οι οποίοι οδήγησαν μια επίθεση στη βάση τους της Mariposa και την κατέστρεψαν, σκοτώνοντας τον Δάσκαλο.
Με τον Δάσκαλο νεκρό και το μεγαλύτερο μέρος του στρατού του κυνηγήθηκε από την Αδελφότητα, οι Σούπερ Μουτάντς κατέφυγαν στην έρημο για να προσπαθήσουν να οικοδομήσουν νέες ζωές για τον εαυτό τους. Μία τέτοια προσπάθεια έγινε από τον ευφυή μεταλλαγμένο Μάρκο και, εκπληκτικά, ένας Αδελφός Παλάντιν ονομαζόταν Ιακώβ. Παρά το γεγονός ότι ήταν εχθροί, σύντομα έγιναν σπουδαίοι φίλοι, ιδρύοντας τους Broken Hills ως καταφύγιο για τους ανθρώπους, τις φαντάσματα και τους μεταλλαγμένους να ζουν αρμονικά. Ο Μάρκους στρατολογήθηκε αργότερα από τον Εκλεγμένο για να συμμετάσχει στην προσπάθειά του να σώσει τη φυλή του και το υπόλοιπο της ερημικής περιοχής από τον Εγκλεισμό.
Όταν το Enclave επανεμφανίστηκε το 2241, προσπάθησαν να χρησιμοποιήσουν το FEV για να βοηθήσουν στην παγκόσμια γενοκτονία τροποποιώντας το για να σκοτώσει οτιδήποτε με μεταλλαγμένο DNA. Χρησιμοποιώντας τους αιχμαλωτισμένους κατοίκους του NCR που αναγκάστηκαν να δουλέψουν, έσκαψαν τα ερείπια της Mariposa για να βρουν τα υπόλοιπα δοχεία του FEV. Οι δοκιμές τους οδήγησαν επίσης στη μετατροπή ενός στρατιώτη του Enclave που ονομάζεται Frank Horrigan σε ένα ισχυρό υβρίδιο Super Mutant. Προτού μπορέσουν να αναπτύξουν το τροποποιημένο στέλεχος, ο Chosen One διείσδυσε στο HQ τους και κατέστρεψε τη βάση μαζί με το απόθεμά τους.
Στη συνέχεια, χωρίς να υπάρχει πλέον FEV στη Δύση, το Super Mutants έγινε όλο και πιο σπάνιο να συναντηθεί. Παρά τις προσπάθειες ενσωμάτωσης στις ανθρώπινες κοινότητες, πολλοί εξακολουθούσαν να μην εμπιστεύονται ή να ξενοφοβούν απέναντι στους μεταλλαγμένους. Στο Mojave, το Jacobstown ιδρύθηκε για να παρέχει ασφάλεια σε μεταλλάκτες και θεραπεία σε όσους εξακολουθούν να πάσχουν από ψύχωση και επιθετικότητα.
Ενώ η Mariposa ήταν το κύριο ερευνητικό κέντρο για το FEV, δεν ήταν το μόνο μέρος στη χώρα που περιείχε τον περίφημο ιό. Σε τοποθεσίες όπως η Capital Wasteland, η Κοινοπολιτεία και η Appalachia, οι επιστήμονες είχαν τα δικά τους καταστήματα FEV, τα οποία χρησιμοποιούν για να πειραματιστούν σε διάφορα θέματα. Αυτά τα Super Mutants ήταν ως επί το πλείστον τα ίδια με τους ομολόγους τους στη Δυτική Ακτή, εκτός από το ότι οι παλαιότεροι συνέχισαν να μεγαλώνουν, γίνονται ισχυροί μεγαθήριοι. Δεν είχαν επίσης σαφή ηγετική δομή και ήταν πολύ λιγότερο οργανωμένες, κυρίως λόγω του ότι οι ευφυείς μεταλλάκτες ήταν πολύ πιο σπάνιοι. Παρόλα αυτά, εξακολουθούσαν να αποτελούν σοβαρή απειλή στις αντίστοιχες περιοχές τους.
Το Capital Wasteland Mutants προέρχεται από Θόλος 88 , που πειραματίστηκαν στους κατοίκους τους με το FEV. Το τοπικό κεφάλαιο της Αδελφότητας οδήγησε έναν μακρόχρονο πόλεμο 20 ετών για να τους συγκρατήσει πριν μάθουν τελικά από πού προήλθαν και κατέστρεψαν το Vault το 2277. Εκείνη τη στιγμή, το Enclave επανεμφανίστηκε, επιθυμώντας να συνεχίσει τα σχέδιά του για να σκοτώσει οτιδήποτε μεταλλάχθηκε. Ευτυχώς, οι προσπάθειές της σταμάτησαν από τον Lone Wanderer και την Αδελφότητα, ενώ επίσης κατέστρεψαν το τελευταίο γνωστό δείγμα του τροποποιημένου FEV.
Στην Κοινοπολιτεία, το Ινστιτούτο είχε κατά κάποιο τρόπο τη δική του προμήθεια του FEV και ξεκίνησε μια προσπάθεια να δημιουργήσει μια νέα φυλή μεταλλαγμένων που θα ενεργούσαν ως εργάτες και στρατιώτες στην επιφάνεια. Ενώ οι ερευνητές αργότερα επικεντρώθηκαν εκ νέου στην ανάπτυξη προηγμένων συνθέτων για αυτούς τους ρόλους, το Ινστιτούτο συνέχισε να απαγάγει τους εποίκους και να τους μετατρέψει σε μεταλλαγμένους προτού τους απελευθερώσει στη φύση. Δεν εξηγείται ποτέ γιατί, αλλά πολλοί πιστεύουν ότι το Ινστιτούτο το έκανε αυτό για να κρατήσει τις φατρίες της Κοινοπολιτείας διαιρεμένες και ανίκανες να οργανώσουν αρκετά για να τους προκαλέσουν.
Γενικά πιστεύεται ότι δεν υπάρχει θεραπεία για αυτούς που μετατρέπονται σε Super Mutants. Ωστόσο, αυτή η θεωρία απορρίφθηκε μέσω των δράσεων του Δρ. Brian Virgil. Ένας πρώην ερευνητής του Ινστιτούτου, ο Βεργίλ μεταμορφώθηκε σε Σούπερ Μουτάντ και κατέφυγε σε εξορία στη Λαμπερή Θάλασσα. Το 2287, ο Virgil δημιούργησε έναν ορό που επέστρεψε με επιτυχία τη μετάλλαξη, αποκαθιστώντας τον σε ανθρώπινη μορφή. Ωστόσο, η θεραπεία προσαρμόστηκε στο συγκεκριμένο στέλεχος του FEV με το οποίο μολύνθηκε, και η γενίκευση της φόρμουλας για τη θεραπεία οποιουδήποτε άλλου θα μπορούσε να πάρει δεκαετίες.
Παρά τη δυστυχία τους σε όλη τη χέρσα περιοχή, υπήρξαν μια χούφτα Super Mutants που υπερέβησαν την επιθετικότητα τους, προσπαθώντας να κάνουν καλό. Μερικοί μεταλλάκτες όπως ο Marcus, ο Fawkes και ο Strong έγιναν ακόμη πιστοί και ισχυροί σύμμαχοι σε θρυλικούς ήρωες της χερσαίας γης σε όλη την ιστορία.
